- s -

• same_atoms() : AngleGrouping , BondGrouping
• scale_velocities() : Collection , CollectionVerletNPT
• scale_velocities_to_energy() : Collection , CollectionVerletNPT
• scale_velocities_to_temp() : Collection , CollectionVerletNPT
• SCAtomVec() : SCAtomVec
• SCBox() : SCBox
• SCBoxed() : SCBoxed< A, P >
• SCPair() : SCPair
• SCSpringList() : SCSpringList
• SCSpringPair() : SCSpringPair
• set() : Array< T, N > , BivariateGauss , GaussVec , NVector< T, N > , Vector2< T > , Vector3< T >
• set_axis() : SoftWallCylinder
• set_constants() : CollectionDamped , CollectionSol
• set_dt() : CollectionDamped , CollectionGaussianT , CollectionGear3A , CollectionGear4A , CollectionGear4NPH , CollectionGear5A , CollectionGear6A , CollectionNLCG , CollectionNLCGV , CollectionNoseHoover , CollectionOverdamped , CollectionRK4 , CollectionSol , CollectionVerlet , CollectionVerletNPT
• set_epsilon() : CollectionCDgrid
• set_force() : FixedForceAtom , FixedForceRegionAtom , FixedSpringAtom
• set_forces() : AngleTriples , BondPairs , Charges , Collection , CollectionGaussianT , CollectionGear4NPT , CollectionNLCG , COMSpring , Dihedrals , FixedForce , FixedForceRegion , FixedSpring , Interaction , InteractionPairsX , NListed< A, P > , NListedVirial< A, P > , RandomForce , SCBoxed< A, P > , SCSpringList , SimpleListed< A, P > , SoftWall , SoftWallCylinder
• set_forces_get_pressure() : AngleTriples , BondPairs , Collection , Dihedrals , Interaction , NListed< A, P > , NListedVirial< A, P > , RandomForce , SCBoxed< A, P > , SCSpringList , SimpleListed< A, P > , SoftWall , SoftWallCylinder
• set_forces_get_stress() : NListed< A, P > , SCSpringList
• set_gauss() : CollectionSolHT
• set_kappa() : CollectionNLCG
• set_location() : SoftWall , SoftWallCylinder
• set_max_alpha() : CollectionNLCG , CollectionNLCGV
• set_max_alpha_fraction() : CollectionNLCG , CollectionNLCGV
• set_max_dx() : CollectionNLCG , CollectionNLCGV
• set_max_step() : CollectionNLCG , CollectionNLCGV
• set_normal() : SoftWall
• set_pressure_goal() : CollectionNLCG
• set_Q() : CollectionNoseHoover
• set_U0() : EnergyTracker
• set_xi() : CollectionGaussianT
• setForcesGetEnergy() : NListedVirial< A, P >
• setx() : Vector2< T > , Vector3< T >
• setxd() : Vector2< T > , Vector3< T >
• sety() : Vector2< T > , Vector3< T >
• setyd() : Vector2< T > , Vector3< T >
• setz() : Vector3< T >
• setzd() : Vector3< T >
• shear() : LeesEdwardsBox
• shear_to() : LeesEdwardsBox
• SimpleListed() : SimpleListed< A, P >
• size() : AngleTriples , AtomGroup , AtomVec , BondPairs , Charges , CNodePath , Dihedrals , FixedForce , FixedForceRegion , FixedSpring , JammingList , JammingTree , JammingTreeRot , NeighborList , NListed< A, P > , PairList , RandomForce , SCAtomVec , SimpleListed< A, P > , SubGroup
• smooth_locs() : SmoothLocs
• SmoothLocs() : SmoothLocs
• SoftWall() : SoftWall
• SoftWallCylinder() : SoftWallCylinder
• Spring() : Spring
• sq() : NumVector< T, N >
• StaticCollec() : StaticCollec
• status_str() : pyparm.packmin.Minimizer
• std_dists() : AngleTriples , BondPairs
• stepx() : CollectionNLCG , CollectionNLCGFixedL , CollectionNLCGV
• straight_diff() : JammingTreeRot
• straight_distsq() : JammingTreeRot
• stress() : Interaction , NListed< A, P > , SCSpringList
• SubGroup() : SubGroup
• SymmetricInverse() : Matrix< C >