Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- s -
- same_atoms()
: AngleGrouping
, BondGrouping
- scale_velocities()
: Collection
, CollectionVerletNPT
- scale_velocities_to_energy()
: Collection
, CollectionVerletNPT
- scale_velocities_to_temp()
: Collection
, CollectionVerletNPT
- SCAtomVec()
: SCAtomVec
- SCBox()
: SCBox
- SCBoxed()
: SCBoxed< A, P >
- SCPair()
: SCPair
- screen
: Charges
, ElectricScreened
- SCSpringList()
: SCSpringList
- SCSpringPair()
: SCSpringPair
- sec
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- seceps
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- secmax
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- set()
: Array< T, N >
, BivariateGauss
, GaussVec
, NVector< T, N >
, Vector2< T >
, Vector3< T >
- set_axis()
: SoftWallCylinder
- set_constants()
: CollectionDamped
, CollectionSol
- set_dt()
: CollectionDamped
, CollectionGaussianT
, CollectionGear3A
, CollectionGear4A
, CollectionGear4NPH
, CollectionGear5A
, CollectionGear6A
, CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
, CollectionNoseHoover
, CollectionOverdamped
, CollectionRK4
, CollectionSol
, CollectionVerlet
, CollectionVerletNPT
- set_epsilon()
: CollectionCDgrid
- set_force()
: FixedForceAtom
, FixedForceRegionAtom
, FixedSpringAtom
- set_forces()
: AngleTriples
, BondPairs
, Charges
, Collection
, CollectionGaussianT
, CollectionGear4NPT
, CollectionNLCG
, COMSpring
, Dihedrals
, FixedForce
, FixedForceRegion
, FixedSpring
, Interaction
, InteractionPairsX
, NListed< A, P >
, NListedVirial< A, P >
, RandomForce
, SCBoxed< A, P >
, SCSpringList
, SimpleListed< A, P >
, SoftWall
, SoftWallCylinder
- set_forces_get_pressure()
: AngleTriples
, BondPairs
, Collection
, Dihedrals
, Interaction
, NListed< A, P >
, NListedVirial< A, P >
, RandomForce
, SCBoxed< A, P >
, SCSpringList
, SimpleListed< A, P >
, SoftWall
, SoftWallCylinder
- set_forces_get_stress()
: NListed< A, P >
, SCSpringList
- set_gauss()
: CollectionSolHT
- set_kappa()
: CollectionNLCG
- set_location()
: SoftWall
, SoftWallCylinder
- set_max_alpha()
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- set_max_alpha_fraction()
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- set_max_dx()
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- set_max_step()
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- set_normal()
: SoftWall
- set_pressure_goal()
: CollectionNLCG
- set_Q()
: CollectionNoseHoover
- set_U0()
: EnergyTracker
- set_xi()
: CollectionGaussianT
- setForcesGetEnergy()
: NListedVirial< A, P >
- setx()
: Vector2< T >
, Vector3< T >
- setxd()
: Vector2< T >
, Vector3< T >
- sety()
: Vector2< T >
, Vector3< T >
- setyd()
: Vector2< T >
, Vector3< T >
- setz()
: Vector3< T >
- setzd()
: Vector3< T >
- shear()
: LeesEdwardsBox
- shear_to()
: LeesEdwardsBox
- sig
: IEpsRepsSigCutAtom
, LJAttractFixedRepulsePair
, LJAttractRepulsePair
, LoisLinPair
, LoisOhernPair
, RepulsionDragPair
, RepulsionPair
, SCSpringPair
- sigcut
: EpsSigCutAtom
, IEpsISigCutAtom
, IEpsRepsSigCutAtom
, IEpsRepsSigExpCutAtom
, IEpsSigCutAtom
, LoisLinPair
, LoisOhernPair
- sigma
: EpsSigAtom
, EpsSigExpAtom
, EpsSigExpDragAtom
, IEpsRepsSigExpCutAtom
, IEpsSigCutAtom
, LennardJonesCut
, LJAttract
, LJAttractCut
, LJishPair
, LJRepulsePair
, LJRepulsive
, LoisLinAtom
, LoisOhernAtom
, WallAtom
- sigmai
: EisMclachlanAtom
- sigmar
: CollectionSol
- sigmas
: IEpsISigCutAtom
, IEpsISigExpAtom
- sigmav
: CollectionSol
- sim
: pyparm.packmin.Minimizer
- SimpleListed()
: SimpleListed< A, P >
- sincoeffs
: Dihedral
- singles
: ISFTracker
, RsqTracker
- size()
: AngleTriples
, AtomGroup
, AtomVec
, BondPairs
, Charges
, CNodePath
, Dihedrals
, FixedForce
, FixedForceRegion
, FixedSpring
, JammingList
, JammingTree
, JammingTreeRot
, NeighborList
, NListed< A, P >
, PairList
, RandomForce
, SCAtomVec
, SimpleListed< A, P >
, SubGroup
- skin
: NeighborList
- skip
: ISFTracker1
, RDiffs
, RsqTracker1
- skipn
: SmoothLocs
- smooth_locs()
: SmoothLocs
- SmoothLocs()
: SmoothLocs
- smoothn
: SmoothLocs
- SoftWall()
: SoftWall
- SoftWallCylinder()
: SoftWallCylinder
- Spring()
: Spring
- springk
: BondAngle
, Spring
- sq()
: NumVector< T, N >
- StaticCollec()
: StaticCollec
- status_str()
: pyparm.packmin.Minimizer
- std_dists()
: AngleTriples
, BondPairs
- stepmax
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGV
- stepx()
: CollectionNLCG
, CollectionNLCGFixedL
, CollectionNLCGV
- straight_diff()
: JammingTreeRot
- straight_distsq()
: JammingTreeRot
- stress()
: Interaction
, NListed< A, P >
, SCSpringList
- SubGroup()
: SubGroup
- SymmetricInverse()
: Matrix< C >