- d -

• damping : CollectionDamped , CollectionSol , CollectionSolHT
• data : CollectionRK4
• dddV : CollectionGear4NPH
• ddV : CollectionGear4NPH
• delta : SpheroCylinderDiff
• derivs : DihedralDerivs
• desT : CollectionSol , CollectionSolHT
• diameters : NeighborList
• diff_type : BondGrouping
• dih : DihedralGrouping
• direction : FixedForceRegionAtom
• dist : EisMclachlanAtom
• distance : CNodePath
• distance_squared : JammingList
• distro : BivariateGauss , GaussVec
• dists : ContactTracker , RDiffs
• ds : CollectionGear6A
• dt : CollectionCD , CollectionCDgrid , CollectionDamped , CollectionGaussianT , CollectionGear3A , CollectionGear4A , CollectionGear4NPH , CollectionGear4NPT , CollectionGear5A , CollectionGear6A , CollectionNLCG , CollectionNLCGV , CollectionNoseHoover , CollectionOverdamped , CollectionRK4 , CollectionSol , CollectionSolHT , CollectionVerlet , CollectionVerletNPT
• dV : CollectionGear4NPH
• dxmax : CollectionNLCG , CollectionNLCGV
• dxsum : CollectionNLCG , CollectionNLCGV